BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Các nhiệm vụ khác
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  14,858,632
  • Kết quả thực hiện nhiệm vụ

Xác định cấu trúc tetramer của peptide amyloid beta: mô phỏng động lực học phân tử

PTN Khoa học Sự sống

UBND TP. Hồ Chí Minh

Tỉnh/ Thành phố

Nguyễn Hoàng Linh

Mai Xuân Lý; Hồ Anh Kiệt;

Hoá sinh; phương pháp nghiên cứu hoá sinh

2019

TP. Hồ Chí Minh

53 tr.

Được thúc đẩy bởi các kết quả về độc tính thần kinh của oligomer Aβ1-42 và tầm quan trọng của cấu trúc các oligomer trong quá trình tự kết tụ, trong đề tài này, chúng tôi tiến hành mô phỏng mô phỏng động lực học phân tử hạt thô kết hợp phương pháp replica exchange (REMD). Mô hình hạt thô làm giảm số bậc tự do từ đó cho phép chúng tôi mô phỏng ở thang thời gian lớn và khoảng nhiệt độ rộng để tăng khả năng lấy mẫu trên không gian pha mà không yêu cầu tài nguyên tính toán lớn. Các cấu trúc thu được được tối ưu hoá bằng mô phỏng MD với tất cả nguyên tử để xác định các tính chất hoá lý của tetramer Aβ1-42. Từ cấu trúc tetramer, chúng tôi so sánh các đặc tính cấu trúc với sợi Aβ1-42 hoàn chỉnh để xác định lí do tại sao cấu trúc oligomer và sợi hoàn chỉnh lại khác biệt nhiều đến thế. Ngoài ra, vai trò của nước trong cấu trúc oligomer và sợi Aβ1-42 cũng được quan tâm, các kết quả thu được là nền tảng cho việc giải thích một số vấn đề trong quá trình kết tụ của các monomer Aβ. Các cấu trúc tetramer thu được từ đề tài có thể được dùng trong các nghiên cứu tương lai để xây dựng oligomer bậc cao hơn và là mục tiêu cho thiết kế thuốc chữa bệnh Alzheimer

Cấu trúc tetramer; Động lực học phân tử; Peptide Amyloid Beta

24 Lý Thường Kiệt, Hà Nội

HCM-065-2020