BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  18,944,732
  • Công bố khoa học và công nghệ Việt Nam

69

Quản lý và khai thác thuỷ sản

Triệu Anh Tuấn, Thái Thanh Bình, Nguyễn Xuân Viết

Mã vạch DNA của loài tu hài (lutraria rhynchaena) ở huyện Vân Đồn, tỉnh Quảng Ninh

DNA barcoding of otter clam (lutraria rhynchaena) in van don district, Quang Ninh province

Tạp chí Khoa học và Công nghệ Đại học Thái Nguyên

2022

5

299-307

1859-2171

Tu hài, Mã vạch DNA, Cytochrome c oxidase subunit I (COI), Lutraria rhychaena, Vân Đồn

Otter clam, DNA Barcoding, Cytochrome coxidase subunit I (COI), Lutraria rhychaena, Van Don

Tu hài (Lutraria rhynchaena) là loài nhuyễn thể hai mảnh vỏ, phân bố chủ yếu tại Vân Đồn, tỉnh Quảng Ninh. Tu hài hiện nay đang được khai thác và nuôi để làm thực phẩm. Nghề nuôi tu hài cũng có nguy cơ thiếu bền vững do dịch bệnh thường xuyên xảy ra. Hiện tượng di nhập tu hài nước ngoài về tiêu thụ tại Việt Nam rất phổ biến. Mặt khác, việc định danh loài tu hài ở Việt Nam còn chưa thật sự rõ ràng và chủ yếu dựa vào hình thái. Nghiên cứu này, dựa trên cơ sở khai thác trình tự vùng gen Cytochrome c oxydase subunit I (COI) của 5 loài tu hài được công bố trên GenBank để xây dựng mã vạch DNA phục vụ công tác phân loại hoặc truy xuất nhanh nguồn gốc các sản phẩm tu hài trên thị trường hiện nay. Đánh giá mức độ tương đồng các trình tự vùng gene COI được thực hiện bằng công cụ BLAST, so sánh trình tự nucleotide được thực hiện bằng chương trình BioEdit, khoảng cách di truyền giữa các trình tự được xác định bằng phần mềm MEGA X. Kết quả nghiên cứu đã xây dựng được cây phát sinh chủng loại phân tách riêng từng loài tu hài nghiên cứu và quan hệ tiến hóa giữa chúng, đồng thời xây dựng được mã vạch DNA từ trình tự vùng gene COI (658 bp) của tu hài Việt Nam.

Otter clam (Lutraria rhynchaena) is a genus of bivalve mollusk, distributed mainly in Van Don, Quang Ninh province. It is currently being exploited and raised for food use. However, frequent outbreaks of diseases have put the otter clam farming profession at risk of unsustainability. The import of foreign otter clam for consumption in Vietnam is becoming popular. On the other hand, the identification of the otter clam species in Vietnam is not really clear and mainly based on morphology. This study was based on the extraction of the Cytochrome c oxidase subunit I (COI) gene sequences of 5 species of otter clam published on GenBank to build DNA barcodes for taxonomy or quick traceability products on the market today. Evaluation of the similarity of COI gene regions was carried out with BLAST tool, nucleotide sequence comparison was performed by BioEdit program, genetic distance between sequences was determined by MEGA X software. The study has built a phylogenetic tree that separates each studied otter clam species and the evolutionary relationship between them, and at the same time built a DNA barcode from the COI (658 bp) gene region sequence of the otter clam in Vietnam.

TTKHCNQG, CTv 178

Xem toàn văn