Thông tin nhà nghiên cứu KH&CN
Mã NNC: CB.626459
PGS. TS Trịnh Xuân Hoàng
Cơ quan/đơn vị công tác: Viện Vật Lý
Lĩnh vực nghiên cứu: Vật lý nguyên tử, vật lý phân tử và vật lý hóa học,
- Danh sách các Bài báo/Công bố KH&CN
- Danh sách các Nhiệm vụ KH&CN đã tham gia
[1] |
Energetic preference and topological constraint effects on the formation of DNA twisted toroidal bundles Nhung T. T. Nguyen, Anh T. Ngo, Trinh Xuan HoangJournal of Chemical Physics 158, 114904 (2023) - Năm xuất bản: 2023; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[2] |
The protein escape process at the ribosomal exit tunnel has conserved mechanisms across the domains of life Phuong Thuy Bui, and Trinh Xuan HoangJournal of Chemical Physics 158, 015102 (2023) - Năm xuất bản: 2023; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[3] |
Electronic properties of twisted multilayer graphene V Hung Nguyen, Trinh X Hoang and J-C CharlierJournal of Physics: Materials 5, 034003 (2022) - Năm xuất bản: 2022; ISSN/ISBN: 2515-7639 |
[4] |
Proteins - a celebration of consilience Tatjana Škrbić, Trinh Xuan Hoang, Achille Giacometti, Amos Maritan and Jayanth R. BanavarInternational Journal of Modern Physics B 36, 2140051 (2022) - Năm xuất bản: 2022; ISSN/ISBN: 0217-9792 |
[5] |
Hydrophobic and electrostatic interactions modulate protein escape at the ribosomal exit tunnel Phuong Thuy Bui and Trinh Xuan HoangBiophysical Journal 120, 4798-4808 (2021) - Năm xuất bản: 2021; ISSN/ISBN: 0006-3495 |
[6] |
Marginally compact phase and ordered ground states in a model polymer with side spheres Tatjana Škrbić, Trinh Xuan Hoang, Achille Giacometti, Amos Maritan, and Jayanth R. BanavarPhysical Review E 104, L012501 (2021) - Năm xuất bản: 2021; ISSN/ISBN: 2470-0045 |
[7] |
Spontaneous dimensional reduction and ground state degeneracy in a simple chain model Tatjana Škrbić, Trinh Xuan Hoang, Achille Giacometti, Amos Maritan, and Jayanth R. BanavarPhysical Review E 104, L012101 (2021) - Năm xuất bản: 2021; ISSN/ISBN: 2470-0045 |
[8] |
Protein escape at the ribosomal exit tunnel: Effect of the tunnel shape Phuong Thuy Bui and Trinh Xuan HoangJournal of Chemical Physics 153, 045105 (2020) - Năm xuất bản: 2020; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[9] |
In silico studies for the interaction of tumor necrosis factor-alpha (TNF-α) with different saponins from Vietnamese ginseng (Panax vietnamesis) Oanh T. P. Kim, Manh D. Le, Hoang X. Trinh and Hai V. NongBiophysics and Physicobiology 13, 173-180 (2016) - Năm xuất bản: 2016; ISSN/ISBN: 2189-4779 |
[10] |
Additive effects of macromolecular crowding and confinement on protein stability Phuong Thuy Bui and Trinh Xuan HoangCommunications in Physics 28, 351-360 (2018) - Năm xuất bản: 2018; ISSN/ISBN: 0868-3166 |
[11] |
Sampling the folding transition state ensemble in a tube-like model of protein Nguyen Ba Hung, Trinh Xuan HoangCommunications in Physics 29, 129-139 (2019) - Năm xuất bản: 2019; ISSN/ISBN: 0868-3166 |
[12] |
Effects of inter-organism interactions in biofouling on microtopographic surfaces Trinh X. Hoang, Ha T. H. Mai, Anthony B. Brennan and Ly LeBiofouling 35, 684-695 (2019) - Năm xuất bản: 2019; ISSN/ISBN: 0892-7014 |
[13] |
The elixir phase of chain molecules Tatjana Škrbić, Trinh X. Hoang, Amos Maritan, Jayanth R. Banavar, Achille GiacomettiProteins: Structure, Function and Bioinformatics 87, 176-184 (2019) - Năm xuất bản: 2019; ISSN/ISBN: 1097-0134 |
[14] |
The pH-dependent electrostatic interaction of a metal nanoparticle with the MS2 virus-like particles Anh D. Phan, Trinh X. HoangChemical Physics Letters 730, 84-88 (2019) - Năm xuất bản: 2019; ISSN/ISBN: 0009-2614 |
[15] |
Local symmetry determines the phases of linear chains: a simple model for the self-assembly of peptides Tatjana Skrbic, Trinh Xuan Hoang, Amos Maritan, Jayanth R. Banavar and Achille GiacomettiSoft Matter 15, 5596-5613 (2019) - Năm xuất bản: 2019; ISSN/ISBN: 1744-683X |
[16] |
Theoretical Model for the Structural Relaxation Time in Coamorphous Drugs Anh D. Phan, Justyna Knapik-Kowalczuk, Marian Paluch, Trinh X. Hoang, and Katsunori WakabayashiMolecular Pharmaceutics 16, 2992−2998 (2019) - Năm xuất bản: 2019; ISSN/ISBN: 1543-8384 |
[17] |
Protein escape at the ribosomal exit tunnel: Effects of native interactions, tunnel length, and macromolecular crowding Phuong Thuy Bui and Trinh Xuan HoangJournal of Chemical Physics 149, 045102 (2018) - Năm xuất bản: 2018; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[18] |
Sequence dependent aggregation of peptides and fibril formation Nguyen Ba Hung, Duy-Manh Le, and Trinh X. HoangJournal of Chemical Physics 147, 105102 (2017) - Năm xuất bản: 2017; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[19] |
Effective stiffness and formation of secondary structures in a protein-like model Tatjana Škrbić, Trinh X. Hoang, and Achille GiacomettiJournal of Chemical Physics 145, 084904 (2016) - Năm xuất bản: 2016; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[20] |
Effects of macromolecular crowding on protein folding Bui Phuong Thuy, Hoang Thi Thu Huong and Trinh X HoangJournal of Physics: Conference Series 627, 012027 (2015) - Năm xuất bản: 2015; ISSN/ISBN: 1742-6596 |
[21] |
Cascaded plasmon resonant field enhancement in protein-conjugated gold nanoparticles: Role of protein shell Anh D. Phan, Trinh X. HoangJournal of Science: Advanced Materials and Devices 1, 61-64 (2016) - Năm xuất bản: 2016; ISSN/ISBN: 2468-2179 |
[22] |
Folding and escape of nascent proteins at ribosomal exit tunnel Phuong Thuy Bui and Trinh Xuan HoangJournal of Chemical Physics 144, 095102 (2016) - Năm xuất bản: 2016; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[23] |
Phase diagram of the ground states of DNA condensates Trinh X. Hoang, Hoa Lan Trinh, Achille Giacometti, Rudolf Podgornik, Jayanth R. Banavar, and Amos MaritanPhysical Review E (Rapid Communications) 92, 060701(R) (2015) - Năm xuất bản: 2015; ISSN/ISBN: 1539-3755 |
[24] |
From toroidal to rod-like condensates of semiflexible polymers Trinh Xuan Hoang, Achille Giacometti, Rudolf Podgornik, Nhung T. T. Nguyen, Jayanth R. Banavar, and Amos MaritanJOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS 140, 064902 (2014) - Năm xuất bản: 2014; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[25] |
Surface plasmon resonances of protein-conjugated gold nanoparticles on graphitic substrates Anh D. Phan, Trinh X. Hoang, Thi H. L. Nghiem, and Lilia M. WoodsApplied Physics Letters 103, 163702 (2013) - Năm xuất bản: 2013; ISSN/ISBN: 1077-3118 |
[26] |
Aggregation of peptides in the tube model with correlated sidechain orientations Nguyen Ba Hung and Trinh Xuan HoangJournal of Physics: Conference Series 627, 012028 (2015) - Năm xuất bản: 2015; ISSN/ISBN: 1742-6596 |
[27] |
Folding of proteins in presculpted free energy landscape Nguyen Ba Hung and Trinh Xuan HoangCommunications in Physics 23 (4), (2013) - Năm xuất bản: 2013; ISSN/ISBN: 0868-3166 |
[28] |
Effects of ribosomal exit tunnel on protein´s cotranslational folding Bui Phuong Thuy and Trinh Xuan HoangCommunications in Physics 23, 219-225 (2013) - Năm xuất bản: 2013; ISSN/ISBN: 0868-3166 |
[29] |
Repulsive interactions of a lipid membrane with graphene in composite materials Anh D. Phan, Trinh X. Hoang, The-Long Phan, and Lilia M. WoodsJournal of Chemical Physics 139, 184703 (2013) - Năm xuất bản: 2013; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[30] |
Symmetry and Folded Structures of Biomolecules T. X. Hoang, N. T. T. Nhung, J. R. Banavar, A. Maritan4th International Conference on Biomedical Engineering in Vietnam, IFMBE Proceedings (Springer) 40, pp. 372–375, 2013 - Năm xuất bản: 2013; ISSN/ISBN: 1680-0737 |
[31] |
Evolution of protein-protein interaction networks in duplication-divergence model Bui Phuong Thuy, Trinh Xuan HoangCommunications in Physics 22, 7-14 (2012) - Năm xuất bản: 2012; ISSN/ISBN: 0868-3166 |
[32] |
Protein Sequence and Structure: Is One More Fundamental than the Other? Jayanth R. Banavar, T. X. Hoang, F. Seno, A. Trovato, A. MaritanJournal of Statistical Physics 148, 636 (2012) - Năm xuất bản: 2012; ISSN/ISBN: 0022-4715 |
[33] |
Shapes of hydrophobic thick membranes Trinh X. Hoang, Jayanth R. Banavar and Amos MaritanEurophysics Letters 98, 56006 (2012) - Năm xuất bản: 2012; ISSN/ISBN: 0295-5075 |
[34] |
Sequence repeats and protein structure Trinh X. Hoang, Antonio Trovato, Flavio Seno, Jayanth R. Banavar, and Amos MaritanPhysical Review E: Rapid Communications 86, 050901(R) (2012) - Năm xuất bản: 2012; ISSN/ISBN: 1539-3755 |
[35] |
Coarse grained description of protein folding M. Cieplak, T. X. HoangPhysical Review E 58, 3589-3596 (1998) - Năm xuất bản: 1998; ISSN/ISBN: 1539-3755 |
[36] |
Protein folding and models of dynamics on the lattice T. X. Hoang, M. CieplakJournal of Chemical Physics 109, 9192-9196 (1998) - Năm xuất bản: 1998; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[37] |
Energy landscapes, supergraphs, and ‘‘folding funnels’’ in spin systems P. Garstecki, T. X. Hoang, M. CieplakPhysical Review E 60, 3219-3226 (1999) - Năm xuất bản: 1999; ISSN/ISBN: 1550-2376 |
[38] |
Scaling of folding properties in simple models of proteins M. Cieplak, T. X. Hoang, M. S. LiPhysical Review Letters 83, 1684-1687 (1999) - Năm xuất bản: 1999; ISSN/ISBN: 1079-7114 |
[39] |
Transport properties through graphene grain boundaries: strain effects versus lattice symmetry V. Hung Nguyen, Trinh X. Hoang, P. Dollfus and J.-C. CharlierNanoscale 8, 11658 (2016) - Năm xuất bản: 2016; ISSN/ISBN: 2040-3364 |
[40] |
From polymers to proteins: the effect of side chains and broken symmetry on the formation of secondary structures within a Wang–Landau approach Tatjana Skrbic, Artem Badasyan, Trinh Xuan Hoang, Rudolf Podgornik and Achille GiacomettiSoft Matter 12, 4783 (2016) - Năm xuất bản: 2016; ISSN/ISBN: 1744-683X |
[41] |
Sequencing of folding events in Go-type proteins T. X. Hoang and M. CieplakJournal of Chemical Physics 113, 8319-8328, 2000 - Năm xuất bản: 2000; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[42] |
Molecular dynamics of folding of secondary structures in Go-type models of proteins T. X. Hoang and M. CieplakJournal of Chemical Physics 112, 6851-6862, 2000 - Năm xuất bản: 2000; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[43] |
Kinetic non-optimality and vibrational stability of proteins M. Cieplak and T. X. HoangProteins: Structure, Function and Bioinformatics 44, 20-25, 2001 - Năm xuất bản: 2001; ISSN/ISBN: 0887-3585 |
[44] |
The range of the contact interactions and the kinetics of the Go models of proteins M. Cieplak, and T. X. HoangInternational Journal of Modern Physics C 13, 1231-1242, 2002 - Năm xuất bản: 2002; ISSN/ISBN: 0129-1831 |
[45] |
Folding pathways of prion and doppel G. Settanni, T. X. Hoang, C. Micheletti, and A. MaritanBiophysical Journal 83, 3533-3541, 2002 - Năm xuất bản: 2002; ISSN/ISBN: 0006-3495 |
[46] |
Folding and stretching in a Go-like model of titin M. Cieplak, T. X. Hoang, and M. O. RobbinsProteins: Structure, Function and Bioinformatics 49, 114-124, 2002 - Năm xuất bản: 2002; ISSN/ISBN: 0887-3585 |
[47] |
Thermal folding and mechanical unfolding pathways of protein secondary structures M. Cieplak, T. X. Hoang, and M. O. RobbinsProteins: Structure, Function and Bioinformatics 49, 104-113, 2002 - Năm xuất bản: 2002; ISSN/ISBN: 0887-3585 |
[48] |
Spin analogs of proteins: scaling of “folding” properties T. X. Hoang, N. Sushko, M. S. Li, and M. CieplakJournal of Physics A 33, 3977-3987, 2000 - Năm xuất bản: 2000; ISSN/ISBN: 0305-4470 |
[49] |
Prediction of protein secondary structures from conformational bias T. X. Hoang, M. Cieplak, J. R. Banavar, and A. MaritanProteins: Structure, Function and Bioinformatics 48, 558-565, 2002 - Năm xuất bản: 2002; ISSN/ISBN: 0887-3585 |
[50] |
Universality classes in protein folding times M. Cieplak, and T. X. HoangBiophysical Journal 84, 475-488, 2003 - Năm xuất bản: 2003; ISSN/ISBN: 0006-3495 |
[51] |
Assembly of protein tertiary structures from secondary structures using optimized potentials T. X. Hoang, F. Seno, J. R. Banavar, M. Cieplak and A. MaritanProteins 52, 155-165, 2003 - Năm xuất bản: 2003; ISSN/ISBN: 0887-3585 |
[52] |
Folding of proteins in Go models with angular interactions M. Cieplak and T. X. HoangPhysica A 330, 195-205, 2003 - Năm xuất bản: 2003; ISSN/ISBN: 0378-4371 |
[53] |
Elasticity of semiflexible polymers with and without interactions A. Rosa, T. X. Hoang, D. Marenduzzo and A. MaritanMacromolecules 36, 10095-10102, 2003 - Năm xuất bản: 2003; ISSN/ISBN: 0024-9297 |
[54] |
Geometry and symmetry pre-sculpt the free energy landscape of proteins T. X. Hoang, A. Trovato, F. Seno, J. R. Banavar, and A. MaritanProceedings of the National Academy of Sciences of USA 101, 7960-7964, 2004 - Năm xuất bản: 2004; ISSN/ISBN: 0027-8424 |
[55] |
Unified perspective on proteins: A physics approach J. R. Banavar, T. X. Hoang, A. Maritan, F. Seno, and A. TrovatoPhysical Review E 70, 041905, 2004 - Năm xuất bản: 2004; ISSN/ISBN: 1539-3755 |
[56] |
First principles design of nanomachines J. R. Banavar, M. Cieplak, T. X. Hoang, A. MaritanProceedings of the National Academy of Sciences of USA 106, 6900-6903, 2009 - Năm xuất bản: 2009; ISSN/ISBN: 0027-8424 |
[57] |
Scaling of folding properties in Go models of proteins M. Cieplak and T. X. HoangJournal of Biological Physics 26, 273-294, 2000 - Năm xuất bản: 2000; ISSN/ISBN: 0092-0606 |
[58] |
Common attributes of native-state structures of proteins, disordered proteins, and amyloid T. X. Hoang, L. Marsella, A. Trovato, F. Seno, J. R. Banavar, A. MaritanProceedings of the National Academy of Sciences of USA 130,6883-6888, 2006 - Năm xuất bản: 2006; ISSN/ISBN: 0027-8424 |
[59] |
Structural motifs of biomolecules J. R. Banavar, T. X. Hoang, J. H. Maddocks, et al.Proceedings of the National Academy of Sciences of USA 104, 17283, 2007 - Năm xuất bản: 2007; ISSN/ISBN: 0027-8424 |
[60] |
Symmetry, shape and order A. Trovato, T. X. Hoang, J. R.Banavar, A. MaritanProceedings of the National Academy of Sciences of USA 104, 19187, 2007 - Năm xuất bản: 2007; ISSN/ISBN: 0027-8424 |
[61] |
Thermal Effects in Stretching of Go-like Models of Titin and Secondary Structures M. Cieplak, T. X. Hoang, and M. O. RobbinsProteins 56, 285-297, 2004 - Năm xuất bản: 2004; ISSN/ISBN: 0887-3585 |
[62] |
Stretching of homopolymers and contact order M. Cieplak, T. X. Hoang, and M. O. RobbinsPhysical Review E 70, 11917, 2004 - Năm xuất bản: 2004; ISSN/ISBN: 1539-3755 |
[63] |
Stretching of proteins in the entropic limit M. Cieplak, T. X. Hoang, and M. O. RobbinsPhysical Review E 69, 11912, 2004 - Năm xuất bản: 2004; ISSN/ISBN: 1539-3755 |
[64] |
Form of growing strings D. Marenduzzo, T. X. Hoang, F. Seno, M. Vendruscolo and A. MaritanPhysical Review Letters 95, 098103, 2005 - Năm xuất bản: 2005; ISSN/ISBN: 0031-9007 |
[65] |
Mechanical properties of the domains of titin in a Go-like model M. Cieplak, A. Pastore and T. X. HoangJournal of Chemical Physics 112, 5906, 2005 - Năm xuất bản: 2005; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[66] |
A new interpolation formula for semiflexible polymers A. Rosa, T. X. Hoang, D. Marenduzzo and A. MaritanBiophysical Chemistry 115,251-254, 2005 - Năm xuất bản: 2005; ISSN/ISBN: 0301-4622 |
[67] |
Geometrical model for the native-state folds of proteins T. X. Hoang, A. Trovato, F. Seno, J. R. Banavar, A.MaritanBiophysical Chemistry 115,289-294, 2005 - Năm xuất bản: 2005; ISSN/ISBN: 0301-4622 |
[68] |
What determines the structures of native folds of proteins? A. Trovato, T. X. Hoang, J. R. Banavar, F. Seno, A. MaritanJournal of Physics: Cond. Matt. 17, S1515-S1522, 2005 - Năm xuất bản: 2005; ISSN/ISBN: 0953-8984 |
[69] |
Protein and polymers J. R. Banavar, T. X. Hoang and A.MaritanJournal of Chemical Physics 112, 234910, 2005 - Năm xuất bản: 2005; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[70] |
Marginal compactness of protein native structures T. X. Hoang, A. Trovato, F. Seno,J. R. Banavar and A. MaritanJournal of Physics: Cond. Matt. 18,297-306, 2006 - Năm xuất bản: 2006; ISSN/ISBN: 0953-8984 |
[71] |
Geometry of proteins: Hydrogen bonding, sterics, and marginally compact tubes J. R. Banavar, M. Cieplak, A. Flammini, T. X. Hoang, et al.Physical Review E 73, 31921, 2006 - Năm xuất bản: 2006; ISSN/ISBN: 1539-3755 |
[72] |
Inference of the solvation energy parameters of amino acids using maximum entropy approach T. X. Hoang, F. Seno, A. Trovato, J. R. Banavar, A. MaritanJournal of Chemical Physics 129,35102, 2008 - Năm xuất bản: 2008; ISSN/ISBN: 0021-9606 |
[1] |
Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí: Quỹ phát triển khoa học và công nghệ quốc gia Thời gian thực hiện: 04/2014 - 04/2016; vai trò: Chủ nhiệm nhiệm vụ |
[2] |
Động lực học và hành xử pha của các polymer sinh học trong các mô hình đơn giản Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí: Quỹ phát triển khoa học và công nghệ quốc giaThời gian thực hiện: 01/04/2017 - 01/05/2019; vai trò: Chủ nhiệm nhiệm vụ |
[3] |
Nghiên cứu lý thuyết và mô phỏng về các phân tử sinh học và sự bám dính sinh học Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí: Quỹ phát triển khoa học tự nhiên và công nghệ quốc giaThời gian thực hiện: 01/04/2020 - 01/04/2023; vai trò: Chủ nhiệm nhiệm vụ |
[4] |
Mô hình hóa các phân tử sinh học và các hệ sinh học phức hợp Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí: Quỹ phát triển khoa học và công nghệ quốc giaThời gian thực hiện: 01/2011 - 01/2014; vai trò: Chủ nhiệm đề tài |
[5] |
Nghiên cứu động học của quá trình cuốn protein bằng các phương pháp mô phỏng Cơ quan quản lý nhiệm vụ/cấp kinh phí: Bộ Khoa học và Công nghệThời gian thực hiện: 01/2006 - 12/2008; vai trò: Chủ nhiệm đề tài |