Về kinh tế: Điều tra đánh giá hiện trạng nghề cá ven bờ là cơ sở quan trọng, góp phần định hướng khai thác nguồn lợi hải sản hợp lý, ổn định và từ đó làm tăng hiệu quả kinh tế của ngành thủy sản. Các giải pháp bảo vệ nguồn lợi, bảo vệ bãi sinh sản, ương nuôi nguồn giống hải sản có vai trò quan trọng nhằm duy trì hàng năm lượng bổ sung cho nguồn lợi, từ đó góp phần duy trì bền vững nguồn lợi và làm tăng hiệu quả kinh tế thủy sản cho cộng đồng ngư dân ven biển theo hướng ổn định lâu dài.
Về môi trường: Kết quả điều tra, đánh giá hiện trạng môi trường vùng biển ven bờ của dự án góp phần cung cấp thông tin khoa học để đánh giá xu thế biến động, trên cơ sở đó đề xuất các giải pháp quản lý môi trường, giảm thiểu rủi ro, sự cố ô nhiễm ở vùng biển ven bờ. Các giải pháp dự án đã đề xuất sẽ góp phần bảo vệ nguồn lợi thủy hải sản, môi trường vùng biển ven bờ và định hướng quản lý, phát triển kinh tế thủy sản, kinh tế biển bền vững.
Về xã hội: Kết quả nghiên cứu đánh giá nguồn lợi và nghề cá ven bờ của dự án nhằm cùng cấp cơ sở khoa học cho việc phát triển nghề cá bền vững. Các dữ liệu, thông tin phục vụ trực tiếp công tác quản lý, quy hoạch phát triển ngành thủy sản, duy trì sản lượng khai thác, tạo sinh kế và nâng cao chất lượng đời sống cộng đồng ngư dân ven biển. Đồng thời góp phần ổn định xã hội, phát triển đất nước.
Ý nghĩa khoa học:
Khu hệ động, thực vật phù du ở vùng biển ven bờ lần đầu được xác định, chỉ rõ các đối tượng ưu thế trội quần xã, đối tượng có khả năng gây hại, có khả năng sinh độc tố để cung cấp dữ liệu khoa học cho việc cảnh báo tảo nở hoa, tảo độc ở vùng biển ven bờ. Lần đầu tiên đa dạng sinh học và nguồn lợi hải sản ở vùng biển ven bờ được đánh giá và công bố kết quả. Bổ sung nhiều loài hải sản mới và cập nhật danh sách loài hải sản biển Việt Nam (ngoài các HST đặc thù) từ 941 loài lên 1.264 loài thuộc 592 giống và 235 họ hải sản. Nhiều loài hải sản đặc trưng, phân bố chủ yếu ở vùng biển ven bờ và chưa bắt gặp ở vùng lộng, vùng khơi cũng được xác định và chỉ rõ. Kết quả góp phần hoàn thiện đầy đủ bức tranh trữ lượng nguồn lợi và khả năng khai thác hải sản, cung cấp thông tin khoa học cho quản lý nghề cá biển. Xác định và chỉ rõ những đối tượng hải sản kinh tế, ưu thế có tính chất quyết định đến cấu trúc nguồn lợi hải sản ở vùng biển ven bờ. Bước đầu cũng đã đánh giá được mối liên quan giữa nguồn lợi và các yếu tố môi trường. Mật độ nguồn lợi thường tập trung ở các khu vực có hàm lượng chlorophyll a, mật độ TVPD cao và nhiệt độ nước biển ấm. Các bãi đẻ, bãi ương nuôi tự nhiên nguồn giống thủy sản ở giai đoạn non có xu hướng dịch chuyển và chịu ảnh hưởng của dòng chảy vùng biển ven bờ. Sử dụng dữ liệu hiện có để cung cấp thông tin khoa học, đánh giá về biến động nguồn lợi trước và sau sự cố môi trường, trong đó chỉ rõ nguồn lợi hải sản ở vùng biển ven bờ 4 tỉnh Miền Trung chịu ảnh hưởng lớn bởi sự cố môi trường. Cấu trúc nguồn lợi biến động mạnh và hiện đang bị suy giảm nghiêm trọng (37% mật độ). Số lượng loài hải sản bắt gặp giảm (16 loài), nhiều loài không còn bắt gặp (66 loài) và xuất hiện các đối tượng ở vùng khác di cư vào (50 loài). Lần đầu tiên các dữ liệu về hiện trạng nghề cá ven bờ nước ta được đánh giá và công bố. Dữ liệu nghề cá nước ta đã được bổ sung, cập nhật và dần hoàn thiện, đây là thông tin quan trọng phục vụ cho công tác quản lý, quy hoạch và tái cơ cấu nghề cá để hoạt động hiệu quả và phát triển bền vững. Hoạt động khai thác xâm hại các loài hải sản kinh tế đang ở mức khá cao, sản lượng khai thác chiếm tỷ lệ lớn số lượng cá thể còn non. Công tác quản lý nghề cá và bảo vệ nguồn lợi hải sản ở vùng biển ven bờ còn nhiều hạn chế, công tác thực thi pháp luật và bảo vệ nguồn lợi chưa thực sự hiệu quả, các hình thức khai thác trái phép, hủy diệt vẫn đang xảy ra và tồn tại nhiều nơi. Các loại nghề, hình thức xâm hại nguồn lợi cần cấm và hạn chế khai thác được xác định, bao gồm: nghề đăng đáy biển, nghề rùng, rập xếp, te xiệp, nghề cào bay và các hình thức khai thác hủy diệt nguồn lợi. Cấm hoạt động khai thác trong phạm vi các khu bảo vệ nguồn lợi tiềm năng đã xác định. Hạn chế khai thác đối với nghề lưới kéo, pha xúc, chụp mực, vó mành, lưới vây từ tháng 3-6 ở VBB; tháng 3-4 và tháng 7-8 ở Trung Bộ; tháng 4-5 và tháng 7-8 ở ĐNB; tháng 5-7 và tháng 11-12 ở TNB. Đã xác định được 5 vùng bảo vệ nguồn lợi tiềm năng với tổng số 18 khu vực ven biển nước ta với phạm vi và tọa độ cụ thể. Kết quả này là tiền đề quan trọng cho việc thiết lập vùng bảo vệ nguồn lợi hải sản ở nước ta.