BỘ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ
HỆ THỐNG THÔNG TIN KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ

Lọc theo danh mục
  • Năm xuất bản
    Xem thêm
  • Lĩnh vực
liên kết website
Lượt truy cập
 Lượt truy cập :  16,268,330

Cây rau, cây hoa và cây ăn quả

Đỗ Tấn Khang; Phan Thanh Huynh; Trần Gia Huy; Nguyễn Phạm Anh Thi; Trần Thanh Mến; Nguyễn Văn Ây; Nguyễn Phạm Anh Thi(1); 

Đa dạng di truyền các giống sầu riêng (Durio zibethinus) dựa trên trình tự DNA mã vạch và chỉ thị phân tử ISSR

Genetic diversity of durian (Durio zibethinus) varieties based on DNA barcode sequences and inter simple sequence repeat markers

Khoa học (Đại học Cần Thơ)

2021

4

109-118

1859-2333

DNA mã vạch; ISSR; ITS; MatK; rpoC1; Sầu riêng

DNA barcode; Durian; ISSR; ITS; matK; rpoC1

Sầu riêng (Durio zibethinus) là một trong những giống cây ăn quả đặc sản của Việt Nam được thị trường ưa chuộng. Hiện nay có nhiều giống sầu riêng được trồng tại Đồng bằng sông Cửu Long (ĐBSCL) và khó phân biệt được qua hình thái. Đề tài được thực hiện nhằm bước đầu khảo sát về mặt di truyền dựa trên DNA mã vạch và chỉ thị phân tử ISSR. Trình tự DNA của ba locus DNA mã vạch gồm ITS, matK, rpoC1 của chín giống (Ri-6, Monthong, Khổ Qua Xanh, Chín Hóa, Sữa Hạt Lép, Chuồng Bò, Bí, Musang King và Sáu Hữu) được thu từ Cần Thơ, Tiền Giang, Bến Tre và Vĩnh Long đã được giải trình tự và phân tích. Nghiên cứu đã xác định 6 SNPs của vùng ITS giữa các cá thể Ri-6-Bến Tre, MonthongTiền Giang, Chuồng Bò-Tiền Giang, Sữa Hạt Lép-Cần Thơ và Sáu Hữu-Tiền Giang. Đối với vùng trình tự matK tìm được 9 SNPs phân biệt được các cá thể Ri6 (Cần Thơ và Viện Cây ăn quả miền Nam), Chín Hóa-Bến Tre, Sữa Hạt Lép-Bến Tre và Sáu Hữu-Tiền Giang. Vùng trình tự rpoC1 có độ bảo tồn cao giữa các giống trong nghiên cứu. Cây phân loại dựa trên các dấu phân tử ISSR đã tách các giống sầu riêng thành 5 nhóm và cho thấy sự khác biệt rõ của giống sầu riêng nhập ngoại Musang King-Vĩnh Long và cá thể sầu riêng Monthong-Tiền Giang.

Durian (Durio zibethinus) is one of the special fruits in Vietnam favored with high trade in the world. Currently, there are many varieties of durians grown in the Mekong Delta, and it is challenged to distinguish them through morphology. This study was aimed to examine genetic diversity based on DNA barcode and the ISSR molecular marker. The DNA sequences of three barcode DNA candidates, including ITS, matK, rpoC1 of nine varieties (Ri-6, Monthong, Kho Qua Xanh, Chin Hoa, Sua Hat Lep, Chuong Bo, Bi, Musang King, and Sau Huu) collected from Can Tho, Tien Giang, Ben Tre and Vinh Long were sequenced and analyzed. Six SNPs were identified from the ITS sequence between individuals Ri-6-Ben Tre, Monthong-Tien Giang, Chuong Bo-Tien Giang, Sua Hat Lep-Can Tho, and Sau Huu-Tien Giang. For the matK gene, nine SNPs were found to distinguish Ri-6 individuals (Can Tho and Southern Fruit Research Institute), Chin Hoa-Ben Tre, Sua Hat Lep-Ben Tre and Sau Huu-Tien Giang. The rpoC1 gene was highly conservative between varieties in this study. The ISSR molecular markers classified such durian varieties into five groups and showed clear differences between the exotic varieties of Musang King-Vinh Long and Monthong-Tien Giang.

TTKHCNQG, CVv 403

Xem toàn văn